Nejvyšším orgánem spolku je Členská rada, kterou tvoří všichni členové Artroskopické akademie, z.s.
Statutárním orgánem je předsednictvo spolku.
Předseda spolku: MUDr. Radim Kalina, Ph.D.
Členové předsednictva:
prof. MUDr. Vojtěch Havlas, Ph.D.
prof. MUDr. Tomáš Trč, CSc.
prof. MUDr. Petr Zeman, Ph.D., MBA
doc. MUDr. Jakub Kautzner, Ph.D.
MUDr. Pavel Sadovský
MUDr. René Boglevský
Členové:
MUDr. Roman Bartoš
MUDr. Jiří Demel
MUDr. Ján Grauzel
MUDr. Lukáš Hanák
MUDr. Filip Hudeček
MUDr. Petr Krejčí
MUDr. David Musil, Ph.D.
MUDr. Petr Neoral, Ph.D.
prof. Tomasz Piontek
doc. MUDr. Michal Tuček, Ph.D.